Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

..när det gäller Ubuntu, eller kanske något helt annat. Lite som "Ordet är fritt", men man måste följa de regler som gäller. Här är roligt, trevligt, mysigt och kanske man tar en kopp kaffe tillsammans!
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Innehåll:
  • 1. Presentation av Folding@home och av Ubuntu Sveriges team.
    2a. Guide för att installera Folding@home-klienten i Ubuntu (FAH-version 7). VERSION 7 REKOMMENDERAS! /ubot 2012-07-16

    2b. Guide för att installera Folding@home-klienten i Ubuntu (FAH-version 6.02/6.34).
    3. (ÖVERKURS) Konfigurera Folding@home-klienten för 64-bitars flerkärniga processorer.
    4. (ÖVERKURS) Konfigurera Folding@home-klienten att använda grafikkortets GPU istället för processorns CPU.
    5. (ÖVERKURS) Starta Folding@home-klienten samtidigt som du loggar in i Ubuntu.
    6. (ÖVERKURS) Guide för att skapa ett skript som startar och stoppar klienten beroende på skärmsläckarens status.
    7. (ÖVERKURS) Förklaring till team-statistiken (WU och Score).
    8. (ÖVERKURS) Datorspelet Fold.it (inkl. Linux-klient).


1. Presentation av Folding@home och av Ubuntu Sveriges team:

Jag har skapat ett team som heter Ubuntu Sverige på Folding@home (http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/mai ... num=210289). Folding@home (http://folding.stanford.edu/English/HomePage och http://sv.wikipedia.org/wiki/Folding@home och http://www.youtube.com/watch?v=EZ1XuOgknuE) är ett projekt på Stanford university och som har för avsikt att datoranvändare världen över ska bidra med processorkraft för att hjälpa forskarna hitta förklaringen till svåra sjukdomar som Alzheimers, ALS, cancer, Parkinsons, cystisk fibros m.fl. I praktiken innebär detta att man laddar ner ett program från Folding@home som sedan körs lokalt på datorn. Programmet finns till Linux, Windows XP/Vista/7 och Mac OS X och Playstation 3. Programmet (klienten) använder datorns processor för att utföra beräkningar som hjälper forskarna att förstå hur fel i proteinernas utveckling leder till olika sjukdomar.
Om projektet ska fungera så krävs det att tillräckligt många datoranvändare är med och hjälper Stanfords forskare genom att ladda ner och köra Folding@home-klienten lokalt på datorn. Om tillräckligt många personer hjälper till så kommer "många bäckar små bli till en stor å" och Stanfords forskare får tillgång till en kraftfull "stordator" (http://sv.wikipedia.org/wiki/Distributed_computing). Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team med att forska om svåra sjukdomar!

2a. Guide för att installera Folding@home-klienten i Ubuntu (FAH-version 7):

1. Ladda ner fahclient, fahcontrol och fahviewer som deb-filer här: http://folding.stanford.edu/English/HomePage

2. Installera deb-filerna en i taget genom att dubbelklicka med vänster musknapp på deb-filerna i filbläddraren (filhanteraren). Klicka på deb-filerna i den här ordningen för säkerhets skull: 1. fahclient. 2. fahcontrol 3. fahviewer.

3. Se till att programmet GDebi visar installationsprocessen eftersom du måste svara på frågor under installationen av fahcontrol (användarnamn och team-nummer (Ubuntu Sveriges team-id är: 210289)). Navigera mellan alternativen med tangentbordet. Du hoppar framåt med Tabb-tangenten (och bakåt med Shift+Tabb). Markera ett alternativ med Mellanslag-tangenten och acceptera för att gå vidare med Enter.

4. Nu ska FAHControl vara installerat. Ev. så måste du manuellt starta FAHControl för att proteinvikningen ska sätta igång. Öppna programmet FAHControl och undersök programmets inställningar för fler alternativ!

2b. Guide för att installera Folding@home-klienten i Ubuntu (FAH-version 6.02/6.34):

Här är en guide för hur man laddar ner, konfigurerar och använder Folding@home-klienten för att hjälpa Ubuntu Sveriges team att vika proteiner åt forskarna (http://folding.stanford.edu/English/LinUNIGuide)!

1. Öppna en Terminal.

2. Skapa en katalog som du döper till folding i din Hemkatalog:

Kod: Markera allt

mkdir $HOME/folding
3. Stega in i katalogen folding i Terminalen:

Kod: Markera allt

cd $HOME/folding
4. Ladda ner Folding@home-klienten. För 32-bitars Ubuntu så laddar man ner version 6.02 och för 64-bitars Ubuntu så laddar man ner version 6.34.
Hur vet man om man har 32-bitars Ubuntu eller 64-bitars Ubuntu? Använd det här kommandot i Terminalen för att ta reda på om du har ett 32-bitars eller ett 64-bitars Ubuntu installerat: uname -m
Om svaret blir x86 (t.ex. 686 eller 386) så har du ett 32-bitars operativsystem och om svaret blir x86_64 så har du ett 64-bitars operativsystem. Ladda ner 32-bitars eller 64-bitars klienten beroende på vilket system du har installerat:

64-bitars Ubuntu:

Kod: Markera allt

 wget http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/release/FAH6.34-Linux64.tgz
32-bitars Ubuntu:

Kod: Markera allt

wget http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/release/FAH6.02-Linux.tgz
5. Packa upp tgz-filen:

Kod: Markera allt

tar xzf FAH6.34-Linux64.tgz
eller

Kod: Markera allt

 tar xzf FAH6.02-Linux.tgz
6. Sätt exekveringsrättigheter på skriptet fah6:

Kod: Markera allt

chmod +x fah6
7. Konfigurera Folding@home-klienten med kommandot:

Kod: Markera allt

./fah6 -configonly
8. Acceptera standardinställningarna genom att trycka Enter tills du får upp en fråga om nickname. Då skriver du ditt smeknamn som du vill ska synas i Ubuntu Sverige teamets lista över medlemmar (det behöver inte vara samma nick som du har här på forumet om du inte vill). Fortsätt att acceptera standardinställningarna tills frågan om team number kommer upp. Då anger du team number

Kod: Markera allt

210289
vilket gör att dina proteinvikningar räknas in i Ubuntu Sveriges statistik.

9. Starta Folding@klienten och börja vika proteiner:

Kod: Markera allt

./fah6 -verbosity 9
3. (ÖVERKURS) Konfigurera Folding@home-klienten för 64-bitars flerkärniga processorer:

Den första guiden visar hur man laddar ner, konfigurerar och kör Folding@home-klienten som unicore, d.v.s. genom att använda en av processorns kärnor. Om man har en flerkärnig processor och ett 64-bitars Linux så går det att köra Folding@home-klienten som multicore, d.v.s. använda mer än en av processorns kärnor till att vika proteiner. Fördelen är såklart att klienten använder mer av datorns CPU och därför arbetar effektivare. Nackdelen är att klienten kommer att belasta systemet mer och att mindre av datorns CPU blir över till datorns övriga funktioner.
Här är en guide för hur man konfigurerar Folding@home-klienten att använda multicore-läget istället för unicore-läget. Tänk på att det här kräver ett 64-bitars operativsystem och att man har laddat ner 64-bitarsversionen av klienten. Jämför stegen här nedanför med steg 7 och 9 i guiden "2. Guide för att installera Folding@home-klienten i Ubuntu.":

Istället för

Kod: Markera allt

./fah6 -configonly
under steg 7 så skriver man (glöm inte att ange nick och team number 210289)

Kod: Markera allt

./fah6 -smp -configonly
och istället för

Kod: Markera allt

./fah6 -verbosity 9
under steg 9 så skriver man

Kod: Markera allt

./fah6 -smp -verbosity 9
Flaggan -smp gör alltså att Folding@home-klienten använder mer än bara en av processorns kärnor vilket leder till högre effektivitet (och därmed mer WU och Score).

4. (ÖVERKURS) Konfigurera Folding@home-klienten att använda grafikkortets GPU istället för processorns CPU:

Använd grafikkortets GPU i Folding@home-klienten på egen risk! Windows GPU-klient är "unstable" och jag tar inget ansvar för vad som händer med ert system eller med er hårdvara!

Jag har testat att köra Windows GPU3-klient med mitt nVidia 8600 GT i Ubuntu 11.04 (i Unity) och det slutade med att grafikkortet blev väldigt varmt och hela Skrivbordet reagerade väldigt långsamt på input från tangentbordet/musen. Jag avbröt därför försöket. Det ska dock enligt uppgift gå att få Folding@homes GPU3-klinet för Windows att fungera i WIne i Ubuntu. Jag har gjort en guide som beskriver hur man använder grafikkortets GPU till Folding@home i Ubuntu. Guiden är mer eller mindre en översättning av den här guiden (http://linuxfah.info/index.php?title=Main_Page) från engelska till svenska.
Här är guiden som beskriver steg för steg hur man använder grafikkortets GPU till att vika proteiner i Ubuntu:

1. För att det ska gå att använda grafikkortets GPU i Folding@home så måste grafikkortet ha stöd för nVidias arkitektur CUDA. Kontrollera att ditt grafikkort finns med på den här sidan över grafikkretsar från nVidia som har stöd för CUDA: http://developer.nvidia.com/cuda-gpus

2. Aktivera ditt grafikkorts proprietära drivrutin i programmet Additional Drivers (Hårdvarudrivrutiner).

3. Om ditt grafikkort har stöd för CUDA och om du har aktiverat grafikkortets proprietära drivrutin så måste du börja med att installera Wine med det här kommandot:

Kod: Markera allt

sudo apt-get install wine
4. För att Linux ska kunna använda CUDA tillsammans med grafikkortet så måste man ladda ner och installera CUDA Toolkit. Man måste använda CUDA Toolkit 3.0 för att allt ska fungera. Skapa en katalog i din Hemkatalog som du döper till CUDA och ladda ner CUDA Toolkit i katalogen. Du gör det här med kommandona:

Kod: Markera allt

mkdir $HOME/CUDA && cd $HOME/CUDA && wget http://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/3_0/toolkit/cudatoolkit_3.0_linux_32_ubuntu9.04.run
Tänk på att det ska vara 32-bitars CUDA Toolkit 3.0 även om du använder 64-bitars Ubuntu.

5. Sätt exekveringsrättigheter på installationsfilen till CUDA Toolkit 3.0:

Kod: Markera allt

chmod +x $HOME/CUDA/cudatoolkit_3.0_linux_32_ubuntu9.04.run
6. Installera CUDA Toolkit 3.0 med det här kommandot:

Kod: Markera allt

cd $HOME/CUDA && sudo ./cudatoolkit_3.0_linux_32_ubuntu9.04.run
7. För att katalogen .wine ska skapas i din användares Hemkatalog så måste Wine köras en gång först. Starta Wine med kommandot:

Kod: Markera allt

wine notepad.exe
När programmet Anteckningar (Notepad) har startat så ska du avsluta Notepad igen. Nu ska katalogen .wine finnas i din Hemkatalog.

8. Därefter måste vi ladda ner två filer som "översätter" kommunikationen mellan CUDA i Linux och Windows. Filerna ska laddas ner till katalogen .wine/drive_c/windows/system32 i din Hemkatalog. Du laddar ner filerna med den här raden kommandon:

Kod: Markera allt

cd $HOME/.wine/drive_c/windows/system32 && wget http://www.linuxfah.info/wrapper-3.0/cudart/cudart.dll.so && wget http://www.linuxfah.info/wrapper-3.0/cufft/cufft.dll.so
Kontrollera att filerna finns i katalogen med kommandot:

Kod: Markera allt

ls -l $HOME/.wine/drive_c/windows/system32/cu*.so
9. Skapa dessa symlänkar genom att köra vart och ett av dessa kommandon i Terminalen en rad i taget:

Kod: Markera allt

ln -s ~/.wine/drive_c/windows/system32/cudart.dll.so ~/.wine/drive_c/windows/system32/cudart32_30_14.dll
ln -s ~/.wine/drive_c/windows/system32/cudart.dll.so ~/.wine/drive_c/windows/system32/cudart.dll
ln -s ~/.wine/drive_c/windows/system32/cudart.dll.so ~/.wine/drive_c/windows/system32/nvcuda.dll
ln -s ~/.wine/drive_c/windows/system32/cufft.dll.so ~/.wine/drive_c/windows/system32/cufft32_30_14.dll
ln -s ~/.wine/drive_c/windows/system32/cufft.dll.so ~/.wine/drive_c/windows/system32/cufft.dll
10. Nu ska vi klistra in sökvägen /usr/local/cuda/lib i filen /etc/ld.so.conf. Det gör man med det här kommandot:

Kod: Markera allt

gksudo gedit /etc/ld.so.conf
Kopiera och klistra in exakt den här raden sist i filen:
/usr/local/cuda/lib
Spara och stäng filen.

11. Kör kommandot (fråga mig inte varför):

Kod: Markera allt

sudo ldconfig
12. Kör kommandona (fråga mig inte varför):

Kod: Markera allt

ldd cufft32_30_14.dll
ldd cudart32_30_14.dll
Om du får orden "not found" i resultatet i Terminalen när du kör kommandona så har du gjort något fel.

13. Skapa en katalog för Folding-projektet. Använd inte samma katalog som du använder för Folding@home unicore/multicore-klient. Det finns risk för konflikter. Kör det här kommandot i Terminalen:

Kod: Markera allt

mkdir $HOME/folding_gpu
14. Ladda ner Folding@homes Windows GPU-klient. I guiden som jag har översatt så länkar man till http://www.stanford.edu/~friedrim/.Fold ... XP-631.zip resp. http://www.stanford.edu/~friedrim/.Fold ... ta-631.zip
Dock finns det en nyare version av Windows GPU3-klient på Folding@homes Download-sida här http://www.stanford.edu/~friedrim/Foldi ... XP-641.zip
Jag vet dock inte om den senaste versionen fungerar tillsammans med den här guiden. Jag rekommenderar att ni testar version 6.31 innan ni testar version 6.41. Så här laddar du ner klienten i katalogen folding_gpu:

Kod: Markera allt

cd $HOME/folding_gpu && wget http://www.stanford.edu/~friedrim/.Folding@home-Win32-GPU_XP-631.zip
eller

Kod: Markera allt

cd $HOME/folding_gpu && wget http://www.stanford.edu/~friedrim/.Folding@home-Win32-GPU_Vista-631.zip
15. Installera programmet unzip för att kunna packa upp zip-filen med klienten i:

Kod: Markera allt

sudo apt-get install unzip
Det är mycket möjligt att programmet unzip redan är installerat på ditt system. Det kommer apt-get i.s.f. meddela när du kör kommandot.

16. Packa upp Windows-klienten:

Kod: Markera allt

cd $HOME/folding_gpu && unzip http://www.stanford.edu/~friedrim/.Folding@home-Win32-GPU_XP-631.zip
eller

Kod: Markera allt

cd $HOME/folding_gpu && unzip http://www.stanford.edu/~friedrim/.Folding@home-Win32-GPU_Vista-631.zip
17. Radera alla dll-filer i som ingick i zip-filen med kommandot:

Kod: Markera allt

cd $HOME/folding_gpu && rm *.dll
18. Starta Windows GPU3-klienten i Wine med det här kommandot:

Kod: Markera allt

nice -n 19 wine Folding@home-Win32-GPU.exe -forcegpu nvidia_g80
Eventuellt måste du byta ut nvidia_g80 mot någonting annat. Om du har mer än ett grafikkort så får du lägga till flaggan -gpu 0 eller gpu -1 beroende på vilken GPU som klienten ska använda. Glöm inte heller att ställa in ditt nick och Ubuntu Sveriges team number/id (210289) första gången du startar klienten.

Om allt fungerar som det ska så kommer Folding@homes GPU3-klient för Windows att köras genom Wine i Ubuntu. :)

Här är en guide som beskriver hur man installerar Ubuntu Server och sedan Windows Folding@home-klient i Wine utan att ha ett grafiskt gränssnitt (X11) på systemet: http://foldingforum.org/viewtopic.php?f=54&t=6793 (Tipstack till larsemil som postade guiden på IRC.)

5. (ÖVERKURS) Starta Folding@home-klienten samtidigt som du loggar in i Ubuntu:

Det finns minst två sätt att göra det här på. Jag rekommenderar den första metoden som innebär att man använder Ubuntus program Uppstartsprogram. Det andra alternativet innebär att man använder Uppstartsprogram tillsammans med ett skript.

Metod 1 bygger på att man lägger in ett kommando som automatiskt startar klienten i programmet Uppstartsprogram (Startup Applications). Du lägger till ett alternativ för automatisk uppstart i Uppstartsprogram och skriver in det här i fältet kommando:

Kod: Markera allt

bash -c "cd $HOME/folding && ./fah6"
Eftersom du startar Folding@home-klienten samtidigt som du loggar in så ser du inte hur många % av ett WU klienten har gjort. Det löser man genom att i Terminalen läsa av klientens loggfil med kommandot:

Kod: Markera allt

tail -f folding/FAHlog.txt
där flaggan -f gör att tail "spottar ut" mer information i takt med att klienten fyller på loggfilen med ny information.

Metod 2 använder Uppstartsprogram tillsammans med ett bash-skript för att starta Folding@home-klienten samtidigt som man loggar in. Så här gör du för att starta klienten m.h.a. ett skript:

1. Skapa ett skript som startar Folding-klienten:

Kod: Markera allt

echo "cd $HOME/folding && ./fah6 -verbosity 9 &" > $HOME/fah.bash
2. Sätt exekveringsrättigheter på skriptet:

Kod: Markera allt

chmod +x $HOME/fah.bash
3. Öppna Ubuntus program Startup Applications och skriv in sökvägen till skriptet i fältet för kommando:

Kod: Markera allt

/home/användarnamn/fah.bash
4. Eftersom ./fah6 nu kommer att starta samtidigt som ni loggar in och eftersom klienten körs i bakgrunden så ser man inte hur många procent klienten har klarat av ett projekt. Om man är nyfiken på hur långt klienten har kommit så ser man det med något av dessa två kommandon i Terminalen:

Kod: Markera allt

tail -f $HOME/folding/FAHlog.txt
eller

Kod: Markera allt

cat $HOME/folding/FAHlog.txt
Om allt fungerar som det ska så ska Folding@home-klienten i fortsättningen starta samtidigt som du loggar in som din användare i Ubuntu. :D

6. (ÖVERKURS) Guide för att skapa ett skript som startar och stoppar klienten beroende på skärmsläckarens status:

Jag har gjort ett skript som startar Folding@home-klienten när skärmsläckaren är aktiv och som stänger av Folding@home-klienten när skärmsläckaren är inaktiv. Det här skriptet gör att klienten bara körs när inte någon sitter framför datorn och arbetar med något. Här är en guide för hur man använder skriptet:

1. Öppna en Terminal.

2. Skapa ett nytt dokument som heter folding_screensaver.bash så här:

Kod: Markera allt

gedit $HOME/folding_screensaver.bash
3. Kopiera och klistra in den här koden i dokumentet folding_screensaver.bash:

Kod: Markera allt

#!/bin/bash

# Script starts and stops Folding@home client depending on screensaver status. Script starts Foldin@home client when screensaver is active and stops Folding@home client when screensaver is inactive.

#Absolute path to Folding@home directory. The Folding@home client must be in the directory variable $dir.
dir=/home/användarnamn/folding

# Name of Folding@home client. Don't forget the (./) in front of the client name!
folding=./fah6

# Check screensaver status every minute.
while true; do
    sleep 60
    status=$(LC_ALL=C gnome-screensaver-command -q | grep -o "active\|inactive")
    pid=$(pidof $folding)
# Start Folding@home client if screensaver status is active and fah6 is not already running.
    if [[ "$status" == "active" && -z "$pid" ]]; then
        cd $dir && $folding -verbosity 9 &
	echo "Script started Folding@home client ($folding) at: $(date +%Y\-%m\-%d\ %H\:%M)." >> folding.log
        checkfolding=yes
# Stop Folding@home client if screensaver status is inactive and if Folding@home client was once started by this script. Otherwise don't stop Folding@home client.
    elif [[ "$status" == "inactive" && "$checkfolding" == "yes" ]]; then
        kill $pid
	echo "Script stopped Folding@home client ($folding) at: $(date +%Y\-%m\-%d\ %H\:%M)." >> folding.log
        checkfolding=no
    fi
done
4. Ersätt "användarnamn" i raden dir=/home/användarnamn/folding så att ditt användarnamn står med, t.ex: dir=/home/stallman/folding

5. Spara och stäng dokumentet och Gedit.

6. Sätt exekveringsrättigheter på skriptet:

Kod: Markera allt

chmod +x $HOME/folding_screensaver.bash
7. Öppna Ubuntus program Uppstartsprogram (Startup Applications).

8. Lägg till ett nytt alternativ och lägg in den här raden under "kommando" i det nya uppstartsalternativet (ändra användarnamn till ditt riktiga användarnamn i Ubuntu):

Kod: Markera allt

/home/användarnamn/folding_screensaver.bash
Om allt fungerar som det ska så ska Folding@home-klienten starta när skärmsläckaren är aktiv och stängas av när skärmsläckaren är inaktiv (d.v.s. när datorn används av någon). Tänk på att det är helt meningslöst att använda det här skriptet tillsammans med skriptet som automatiskt startar Folding@home-klienten samtidigt som man loggar in eftersom det skriptet gör att klienten alltid kommer att köras (oavsett om skärmsläckaren är aktiv eller inaktiv).
Testa om skriptet fungerar genom att logga ut och in igen och sedan sätta igång skärmsläckaren med tangentbordskombinationen Ctrl+Alt+L. Vänta 5 minuter och logga in igen så att skärmsläckaren stängs av och Skrivbordet kommer upp. Öppna filen folding.log i katalogen folding i din Hemkatalog. Om klienten startades och stoppades med skärmsläckaren så ska filen folding.log finnas i Hemkatalogen och innehålla information om när klienten startades och stoppades. :D

7. (ÖVERKURS) Förklaring till team-statistiken (WU och Score):

Jag tänkte jag skulle ge er lite information om hur Folding@home räknar ut statistiken. Statistiken på Ubuntu Sverige-teamets webbsida (http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/mai ... num=210289) visar WU och Score för alla användare (om man har ställt in nicket rätt med ./fah6 -configonly). Det är lätt att tro att den som har flest WU har höst Score men det ser man på statistiken att så är det definitivt inte. Istället är det på det viset att olika WU är olika mycket värda och hur många Score 1st WU ger beror på hur lång tid det tar att göra 100% på Folding@homes referensdator. Det finns mer information om hur Folding@home värderar olika WU i FAQ på Folding@home-sajten: http://folding.stanford.edu/English/FAQ-Points#ntoc3 Posta en kommentar om ni kommer på hur man väljer om man vill vika WU som ger höga eller låga poäng (tar lång eller kort tid)!

8. (ÖVERKURS) Datorspelet Fold.it (inkl. Linux-klient):
Information: http://svt.se/2.108068/1.2538391/datasp ... s-forskare
Fold.it webbsajt (inkl. Linux-klient): http://fold.it/
Senast redigerad av 95 ubot, redigerad totalt 20 gång.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

Du har hoppat över en hel del som man måste välja.
Jag valde nog fel nickname. Avgammal vana blev det itmannen. Inte det som jag använder här. Men det kanske inte spelar någon roll ?

Men vad pysslar detta med ? Och behöver terminalen vara öppen ?

[18:57:25] Protein: ALZHEIMERS DISEASE AMYLOID
[18:57:25]
[18:57:25] Writing local files
[18:57:35] Extra SSE boost OK.
[18:57:35] Writing local files
[18:57:35] Completed 0 out of 250000 steps (0%)
[19:04:26] Writing local files
[19:04:26] Completed 2500 out of 250000 steps (1%)
[19:11:54] Writing local files
[19:11:54] Completed 5000 out of 250000 steps (2%)
[19:18:51] Writing local files
[19:18:51] Completed 7500 out of 250000 steps (3%)
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Vad menar du med att jag har hoppat över saker? Det är bara att acceptera alla alternativ som dom är när du kör ./fah6 -configonly om du inte vill göra några speciella inställningar. Däremot så får du ju ställa in rätt team number och ett nickname (för att Ubuntu Sveriges team ska få credit för dina "vinkningar" och för att ditt nick ska synas på Ubuntu Sveriges team-sida).

Du kan välja vilket nick du vill. Om du vill ändra nick så är det bara att köra ./fah6 -configonly igen och skriva in ett nytt nick när fah6 frågar efter ditt nick. Glöm inte att sätta 210289 som team number bara!

Edit: Vad det sysslar med? Det räknar på proteiners utveckling och laddar upp resultatet till Folding@home när 100% av jobbet är klart. Du får starta folding-klienten med ett &-tecken på slutet om du vill att klienten ska köras i bakgrunden. Du kan stänga Terminalen om du har startar fah6 som en bakgrundsprocess men annars måste Terminalen vara kvar för att skriptet inte ska stängas ner när du stänger Terminalen.
Du kontrollerar med kommandot top att folding-klienten körs på systemet.
Senast redigerad av 2 ubot, redigerad totalt 28 gång.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

ubot skrev:Vad menar du med att jag har hoppat över saker? Det är bara att acceptera alla alternativ som dom är när du kör ./fah6 -configonly om du inte vill göra några speciella inställningar. Däremot så får man ju ställa in rätt team number och ett nickname (för att Ubuntu Sverige team ska frå credit för dina "vinkningar" och för att ditt nick ska synas på Ubuntu Sveriges team-sida).

Du kan välja vilket nick du vill. Om du vill ändra nick så är det bara att köra ./fah6 -configonly igen och skriva in ett nytt nick när fah6 frågar efter ditt nick. Glöm inte att sätta 210289 som team number bara!
Nej det är inte bara att acceptera allt. Man måste skriva in sina val på ett helt gäng ställen. Men spela roll.
Ok så det behöver alltså inte vara samma nickname som här ?
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Det behöver inte vara samma nickname som här och du kan trycka Enter för att välja standardinställningar på alla alternativ utom nick och team number där du får skriva någonting.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

ubot skrev:Det behöver inte vara samma nickname som här och du kan trycka Enter för att välja standardinställningar på alla alternativ utom nick och team number där du får skriva någonting.
Ok.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

När jag kör detta

Kod: Markera allt

~/folding $ ./fah6 -verbosity 9&
Och sen stänger terminalen samt kollar med "top" så är den inte igång ändå.
Du får starta folding-klienten med ett &-tecken på slutet om du vill att klienten ska köras i bakgrunden
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Testa

Kod: Markera allt

./fah6 -verbosity 9 &
med mellanrum mellan 9 och &-tecknet.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

ubot skrev:Testa

Kod: Markera allt

./fah6 -verbosity 9 &
med mellanrum mellan 9 och &-tecknet.
Genast bättre :) Tackar.
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Det var bra att det löste sig. Det tar lång tid att vika proteiner men klienten fortsätter där den slutade sist man använde datorn när man väl startar Folding-klienten igen.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

Det verkar inte vara överdrivet stort intresse för detta ännu. Men det kommer säkert fler som vill hjälpa till lite.
Bild
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Vi får se hur projektet faller ut efter några veckor/månader. Alla gör ju Folding@home en tjänst genom att hjälpa till att vika proteiner men ska Ubuntu Sverige-teamet klättra i statistiken så krävs att många fler hjälper till.
Användarvisningsbild
Dockland
AVREGISTRERAD
Inlägg: 480
Blev medlem: 15 mar 2011, 00:06
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av Dockland »

Fungerade utmärkt. Tack för en bra guide.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

ubot skrev:Vi får se hur projektet faller ut efter några veckor/månader. Alla gör ju Folding@home en tjänst genom att hjälpa till att vika proteiner men ska Ubuntu Sverige-teamet klättra i statistiken så krävs att många fler hjälper till.
Jag har en tämligen kraftfull dator som bara står på "hyllan" sas.
Tror jag ska dra igång den för att dela ut detta.
Den får stå i en skrubb och mysa för sig själv :)
Men då blir det en 11.10 Server.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

Så där ja.
Nu har jag kört igång en separat dator nästan enbart för detta ändamål.
Tänk vad allt går bra och smidigt med Ubuntu-installationer. :)
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

itmannen_online skrev:Så där ja.
Nu har jag kört igång en separat dator nästan enbart för detta ändamål.
Tänk vad allt går bra och smidigt med Ubuntu-installationer. :)
Det låter bra det. ;) Vi får se hur projektet tar sig med tiden.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

Jag ramlade över något trevligt att nyttja tillsammans med detta.
Nämligen FahMon.
http://fahmon.net/download.html

Men man måste fixa det från source, då det inte finns någon deb att tillgå.
Här är nedladdningslänken:
http://fahmon.net/downloads/current.php?linux
Det blev en hel del plock med beroenden som inte fanns i mitt system.
Men till slut så. Det är bara att vara lite envis ibland. :)
Där ser man även hur många poäng varje jobb kommer att ge när det är klart.

Bild
ubot
Inlägg: 4613
Blev medlem: 04 jan 2008, 14:03
OS: Ubuntu
Utgåva: 24.04 Noble Numbat LTS

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av ubot »

Intressant tips itmannen! :) Jag funderar på om det går att se vilka projekt som ger bäst poäng och om det i.s.f. går att i Linux-klienten välja vilket projekt man klienten ska jobba med?
Det hade varit bra om det gick att rikta in klienten på projekt med WU som ger mest Score i statistiken. Går det här tror du?
Om det är möjligt så borde det också vara möjligt att skapa ett skript som automatiskt väljer det bästa alternativet varje gång klienten påbörjar ett nytt projekt.
Användarvisningsbild
itmannen_online
Inlägg: 485
Blev medlem: 26 jul 2011, 23:04
OS: Ubuntu
Ort: Vilhelmina

Re: Hjälp Ubuntu Sveriges Folding@home-team

Inlägg av itmannen_online »

ubot skrev:Intressant tips itmannen! :) Jag funderar på om det går att se vilka projekt som ger bäst poäng och om det i.s.f. går att i Linux-klienten välja vilket projekt man klienten ska jobba med?
Det hade varit bra om det gick att rikta in klienten på projekt med WU som ger mest Score i statistiken. Går det här tror du?
Om det är möjligt så borde det också vara möjligt att skapa ett skript som automatiskt väljer det bästa alternativet varje gång klienten påbörjar ett nytt projekt.
Via denna sida så ser man alla projekt:
http://fah-web.stanford.edu/psummary.html
Och när man klickar på Description så får man mer info.
Men det kommer inte fram antal poäng förrens man söker efter ett projekt.

Klienten:
Bild

Edit:
Nu ligger ni pyrt till grabbar.
Jag har hittat och kör ett projekt som ger 15810 poäng :)
Skriv svar

Återgå till "Ubuntu Café"